Durante mucho tiempo se han trabajado las enzimas con el clásico modelo Llave-Cerradura, en donde cada enzima tiene una estructura rígida y exacta que encaja perfectamente con el sustrato que degrada, como se ve en la siguiente animación al hacer click sobre ella

 

Pero también existe otra teoría, en donde la enzima no es rígida, si no que se amolda a el sustrato y de esa manera es que logra degradar los productos, como en la animación